В 25 столетии ужасная опасность угрожала нашей галактике. Боевые корабли зловещей Империи Баскана атаковали мирные грузовые суда и города с помощью своего нового сверхмощного оружия, колонизируя захваченные земли. Наш Галактический Патруль построил сверхскоростной корабль Британия, дабы раскрыть секретные планы зловещего сверхоружия Басканы. Те, кому была поручена эта операция, назывались Линзменами. Группа воинов, специально подобранная и составленная из лучших в Галактическом Патруле. Они вступили в жестокую битву с врагом при помощи своих линз, и наконец секретные данные были похищены. И тем не менее, после возвращения домой, они столкнулись с опасностью куда более страшной, чем их предыдущие враги.

Сюжет вращается вокруг молодого пилота Хикару Ичидзё, его возлюбленной из Макросс-сериала Мисы Хаясе и начинающей певицы Линн Минмэй. Эта история происходит на фоне беспощадной войны между людьми и Зентради (великанами-мужчинами), обладающими космическим флотом из миллионов кораблей. Зентради и Мельтанди (великаны-женщины) живут отдельно друг от друга и являются врагами друг другу. В ходе войны уничтожается практически всё живое на планете Земля со всеми её жителями. В живых остаются исключительно экипаж Макросса и его жители. Во время этой войны Миса Хаясе и Хаикару Ичидзё оказываются на выжженой войной Земле, где находят город-крепость «Протокультуры» и подают сигнал Макроссу.

Человесчество вышло за пределы галактики и расселилось по другим планетам. Организация называющая себя "Крушители" согласна взяться за любую работу. Нет не подумайте-это не пираты или какие другие плохие ребята, они хорошие, просто это те ребята, которые возьмуться за такие задания от которых уже отказались все другие. И вот такой лихой команде предлагают сделку, срочно доставить на планету Миккола (на лечение) пациентку в анабиозе. Лидер команды Джо соглашается и они вылетают. Однако в космосе начинаются неприятности. Гиперпространственный прыжок срывается и они оказываются вообще в другой части галактики, за ними охотятся военные, приняв их за пиратов. И тут

Задолго до начала времен, когда Солнечная система была лишь облаком межзвездной пыли среди ледяного безмолвия хаоса, Великий Генма, чудовищное воплощение вселенского зла, вел яростную битву против всего сущего, поклявшись превратить космос в мертвое Ничто. Миллиарды лет, порабощая тела невинных и подчиняя себе стихии, бесформенный ужас пожирал галактики и созвездия, и теперь на его пути стоит хрупкая и одинокая планета Земля, чья единственная надежда — горстка загадочных сверхлюдей.Эти бесстрашные и мудрые воины способны одним усилием воли воздействовать на предметы с сокрушительной силой, и скоро их ряды пополнят новички, еще не подозревающие о своих способностях — прекрасная и грозная трансильванская принцесса Луна и простой японский школьник Джо. Когда Нью-Йорк будет лежать в руинах, а Токио превратится в песчаную пустыню, они, познав всё могущество своих удивительных сил, вместе с древним боевым роботом Вегой и собратьями воинами выйдут на решающую битву с Великим Генмой.

Сирота Терри в день своего 16-летия узнает, что он пришелец с планеты Аполло, а его отец - король, был убит злым императором Дазоном.