Наступило будущее, и люди, как это всегда бывает, устремились к звездам. Но мира не получилось. Армия искусственных людей, называемых Некрусом, оказала сопротивление земному правительству. Война все длилась и длилась, пока земляне не придумали одно оружие - супер солдат, выращенных искусственным путем. В плане физических возможностей эти ребята были гораздо круче, чем обычные люди. И все было бы хорошо, если бы земляне не перепугались слишком большой крутости у этих солдат. Желая поскорее избавиться от них, они запустили их на одну орбиту, а через несколько лет один из них вернулся. Причем вернулся не столько для того, чтобы отомстить, а для того, чтобы продолжить мочилово с Некрусом. Этот парень был известен как Гейст.

Много столетий скиталость в Космосе племя Ктулху, после гибели своей планеты. Глава отважных амазонок сир Виолетт, страдала от тоски и печали, пребывая в мечтах о новой планете для дочерей Ктулху. Однажды их корабль попал под власть тайной силы

Ниндзя Воин Тобикаге, рассказывает историю парня по имени Джо Майа.Однажды, Джо становится свидетелем битвы между пришельцами.Космические бомбардировщики с планеты Забум атакуют корабль принцессы с планеты Родарио, которая сбежала от императора Забума.Император злобно планирует захватить Вселенную, а пока он преследует принцессу, звездолет корторой совершил аварийную посадку на Марсе.Джо пробирается на корабль принцессы, что влечет за собой цепь событий, полностью меняющих его жизнь.Оседлав человекоподобных роботов Джо и его друзья, решили дать отпор нехорошему императору, но встретившись с его армией, превышающей их по численности, были поверженны.Когда же казалось, что надежды на спасение нет, из ниоткуда появился робот обладающий невиданной силой и поверг солдатов Забума наземь

На человечество нападает инопланетная раса.
Единственная сила, которая может противостоять им, Роботы-транформеры и их пилоты.
Жизнь земли зависит от силы и храбрости Донкхуга.

Эта часть получилась наиболее кровавой и содержит самую откровенную эротическую сцену во всей Мегазоне. Дизайн стал более серьёзным и реалистичным, качество анимации выросло. Сюжет развивается более плавно и интересно. Чувство угрозы, которое возникло по ходу первой части, выливается уже в по-настоящему масштабные события, которые приводят к интересной развязке.

В конце 20-го века на землю упал корабль пришельцев. Большая часть оборудования корабля уцелела, но никто не выжил. Учёным удалось разобраться в этих технологиях и за 10 лет им удалось восстановить корабль. И вот наконец день пробного запуска настал, но на Землю напали. С тех пор на Землю не однократно нападали, но храбрые лётчики стоят на страже вооружённые новыми космическими технологиями.

0087 год Универсального Века. Прошло семь лет после Годичной войны. Стремясь пресечь остатки сопротивления, Федерация Земли создает Титанов, элитные боевые части. Однако, Титаны отказываются подчиняться, совершая преступления, подобные преступлениям Зеона во время прошедшей войны. В ответ на их поведение, разгневанные граждане, бывшие солдаты Зеона, и даже члены Федеральных Сил создают группу сопротивления, называемую Анти-Земной Альянс. Приближается новая война, а небольшая группа Альянса прибывает на Сторону 7, для получения данных о новом Гандам Марк II

Действие происходит в далёком будущем на пустынной планете Коам. Даба Майроуд и его друг Мираум Као встречают группу воров во главе с Миямой Лилин, которые хотят продать за много денег робота Ла-Гайма. После первой неудачной атаки один из воров — девушка по имени Фаннерия Аму — влюбляется в Дабу, а один из умирающих воров просит Дабу доставить карточку некоему лицу по имени Амандара Камандара. Даба испытывает большие сложности в поисках Амандары, параллельно он будет вести борьбу против воинов Посейдала, которые уничтожили его родное государство, постепенно он будет набирать новых союзников из повстанческих фракций на разных планетах.

В 2050 году в Солнечную систему вторглись пришельцы, называемые инбитами. Превосходя количеством и мощью, они нанесли сокрушительное поражение человеческой расе и оккупировали Землю. Всегда находясь в своих мехах, инбиты скрывали свою сущность. Единственные свободные люди находятся на Марсе и лунах Юпитера. Вскоре после поражения была предпринята миссия по отвоёвыванию Земли, но потерпела неудачу.