Долгое время черепашки-ниндзя скрывались от людей в лабиринтах городской канализации. На протяжении нескольких лет учитель Сплинтер обучал их боевым искусствам и прививал им чувство справедливости. В один прекрасный момент им пришлось подняться наверх, чтобы спасти Нью-Йорк от Шредера, предводителя Клана Футов, захватившего власть в Нью-Йорке. Вместе с отважным репортером Эйприл и ее оператором Верном, бесстрашные воины смогли одержать победу и очистить любимый город от преступности. Леонардо, Микеланджело, Рафаэль и Донателло нашли свое предназначение в этом мире и стали защитниками своего города. Они навели порядок в Нью-Йорке и с чистой совестью могли отправиться на покой, но однажды им вновь пришлось столкнуться с могущественным врагом, угрожающим их городу.

Вооружившись удивительной способностью уменьшаться в размере, но обладать при этом большой силой, мошенник Скотт Лэнг должен стать героем и помочь своему наставнику, доктору Хэнку Пиму, сохранить в тайне существование костюма Человека-муравья от угроз нового поколения.

Город нуждается в героях. Тьма окутала Нью-Йорк в виде Шреддера и его зловещего Клана Футов, у которого имеется железный контроль над всеми, от полицейских до политиков. Будущее выглядит мрачным, пока из канализации не поднимается и не раскрывает своё предназначение четвёрка отверженных братьев — Черепашки-ниндзя. Черепашки должны работать вместе с бесстрашным репортёром Эйприл и её саркастическим оператором Верном Фенвиком, чтобы спасти город и разгадать дьявольский план Шреддера.

Семеро молодых людей, у которых не складываются отношения с прекрасным полом, отправляются в глухую деревушку Мудли, где живет бабушка одного из приятелей. Он обещает компании веселый отдых, а главное – приятное общество одиноких девушек, коих в Мудли навалом и которые будут очень рады приезжим мужчинам. Бабушкин внук оказывается прав, но лишь отчасти: женщины и в самом деле радуются появлению друзей, но совсем по другой причине. Таинственный вирус превратил местных дам в кровожадных зомби, собирающихся с удовольствием полакомиться гостями.

У Джека был пес по кличке «Блеск». Это была самая обыкновенная собака, до тех пор, пока Блеск ни попал в секретную лабораторию. После выхода оттуда он превратился в супрсобаку. Теперь Блеску предстоит жить двойной собачьей жизнью. В своей обычной жизнью он все тот же любящий и преданный друг Джека, но в другой тайной жизни – он первый супергерой собака. Когда происходит преступление, Блекс спешит туда в своем красном трико и с синим плащом за спиной, чтобы покарать преступников и помочь пострадавшим.

Эйприл покупает в подарок Сплинтеру древний японский скипетр, но этот скипетр оказывается совсем не так прост, как казалось вначале. Вскоре выясняется, что он представляет собой своеобразный вариант машины времени, который был придуман японцами много веков назад. Скипетр переносит Эйприл в средневековую Японию, узнав об этом, черепашки решают отправиться за ней. Но вместо того чтобы попасть в храм, где должна находиться Эйприл, туннели времени отправляют черепашек в самую гущу средневекового сражения.

Четыре черепашки и крыса в канализационных трубах Нью-Йорка вляпались в радиационные отходы, мутировали и превратились в человеческого роста разумных черепашек, а крыса, которая раньше жила у японского мастера ниндзя-цу, обучила их боевым искусствам. Черепашки Леонардо, Рафаэль, Микеланджело и Донателло подружились с тележурналисткой и помогли остановить рост молодежной преступности.

Профессор Жилински изобрел машину, способную уменьшать любые предметы, пока он делал доклад о своем изобретении в университете, его собственные дети, вместе со своими друзьями, случайно запустили его машину и… уменьшили себя. Чудом, избежав смерти от ног собственного отца, вернувшегося из университета, уменьшенные дети оказываются на лужайке перед домом. Лужайка, которая раньше казалась им такой маленькой и безопасной, вдруг превращается в непроходимые джунгли, где опасности таятся на каждом шагу. Да, этим детям не позавидуешь.